金門分部時期電子計算機組位於金門農工實習農場一樓,與圖書室比鄰。僅一間教室。91年8月本校綜合教學大樓落成啟用,電子計算機組遷至該樓北側一樓。92學年度,因學校改制,改名電子計算機中心,仍位於原綜合教學大樓一樓北側,分為電算中心辦公室、主機房及個人電腦教室及東側四樓409教室。
民國97年12月底,圖資大樓落成啟用,電算中心辦公室及主機房搬遷至圖資大樓三樓西側,兩間電腦教室則位於圖資大樓一樓東側。
民國101年2月,因應單位整併與顧及全校教職員工生洽公之便利性,圖資處系統組及網路組辦公區,由圖資大樓三樓遷至圖資大樓二樓,與採編組及閱覽組於「圖書資訊處開放式服務櫃檯聯合辦公區」聯合辦公。
民國101年8月,因電算中心自圖資處獨立出來,辦公區亦由圖資大樓二樓遷回圖資大樓三樓西側,並更名為計算機與網路中心辦公室。